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数字式空间多靶标分析系统 GeoMxTM Digital Spatial Profiler

在非小细胞肺癌(NSCLC)组织上一个感兴趣区域中利用表型分割圈选方式分别对肿瘤和微环境部分分别进行基因表达谱分析,发现两者都跟该区域总体基因表达谱有较大差异。

产品介绍

兼顾组织原位及多靶标定量分析功能



肿瘤微环境的复杂性和样本异质性是当前肿瘤免疫研究及转化医学面临的重大挑战。GeoMxTM DSP数字式空间多靶标分析系统解决了目前传统分析平台无法同时获取形态学信息和多重靶标表达数据的难题。


原位分析平台FISH/IHC———————表达谱分析平台RNA-Seq/Microarray



数字式空间多靶标定量分析系统GeoMxTM DSP




GeoMxTM Digital Spatial Profiler

Your GPS for Biology

GeoMxTM DSP数字式空间多靶标分析系统结合了原位影像和数字化单分子定量技术,通过以单细胞水平分辨率的高清组织图像辅助,可对10000多种RNA或多达96种蛋白质进行定量分析,且一天可分析多达12个FFPE组织。


主要特点

多靶标:可在一张FFPE组织上定量分析高达10000多种RNA或最高96种蛋白质

位:采用1-4种荧光抗体染色获取组织的形态学信息

多维度:既可定量分析蛋白质,也可定量分析RNA

高精度:可达单细胞水平

精准定量:采用数字化单分子计数技术,最高达106水平

样本无损:整个操作过程对样本无损伤,利于保存珍贵样本

高通量:一天可分析多达12份组织样本



工作流程

1. 形态学及待分析多靶标抗体/RNA探针染色

2. 根据形态学荧光抗体染色图像挑选感兴趣的区域(ROI)

3. 对每个ROI进行UV照射,切割下待测靶标抗体/RNA探针上结合的Oligo

4. 毛细管依次吸取释放下来的Oligo

5. 将采集的Oligo收集到96孔板中,设备同时获取位置信息

6. 重复步骤3-5,以收集各个ROI中的Oligo

7. 采集到的Oligo通过Nanostring nCounter平台或测序平台进行数字化定量


形态学图像与数字化定量数据相互关联
在GeoMxTM Data Analysis系统,整合了DSP上的形态学图像和nCounter/测序平台上的数字化定量结果数据,让ROI在组织上的空间位置和区域内所有靶标的表达水平相互关联起来,数据分析简单明了。
在GeoMxTM Data Analysis分析软件中,每个ROI在组织染色图片上的具体位置和所有靶标的表达数据一一对应,可在同一个操作界面上同时观察空间定位、细胞形态与靶标表达的相关性。
GeoMxTM DSP Cloud云操作系统让团队合作高效便利
采用云技术整合实验数据的处理、储存、分析、共享,形成一个开放共享、多用户合作的研究生态,让研究团队包括临床医生、生物学家、病理学家、生物信息学家、实验人员等高效协同工作。
肿瘤微环境的研究和生物标志物的开发

GeoMxTM DSP已开发出基于该平台的生物标志物开发的试剂盒,可用于肿瘤免疫、神经退行性疾病的生物标志物的研究及开发。试剂盒分为Core Panel、可选Module 和Custom三个部分,共同组成您的多重待测靶标组合。


Your Interest = Core + Modules + Custom


蛋白、RNA检测试剂盒(不断更新中)




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