M20 Genomics 公司的 VITA 平台采用具有自主知识产权、基于随机引物策略的 M20 Seq 方法,可以实现全样本类型、全物种、全长单细胞转录组研究,并且大幅度提高了单细胞测序的基因检出数,将极大拓宽单细胞技术的应用领域。
VITAPilote 单细胞全长转录组试剂盒包括新鲜组织、冻存组织、石蜡组织的逆转录试剂盒,建库试剂盒以及微球试剂盒。该试剂盒需配合本公司自主研发的 VITACruiser 单细胞制备仪完成从逆转录、单细胞核酸标记到转录组文库构建全过程。本产品可以高效无偏地进行细胞(核)内原位逆转录、细胞标记以及文库构建,显著提高同等测序深度下的基因检出率,从而对数千至数万个细胞中的 RNA 进行测序。
一、技术优势
二、产品性能
三、技术路线
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五、微生物单细胞转录组测序
MscRNA-seq 单细菌转录组测序
基于自主开发的新一代单细胞测序文库构建平台, M20实现了细菌的高通量单细胞RNA测序,目前 已经检测过大肠杆菌、鲍曼不动杆菌、肺炎克雷 伯菌等多种类型的细菌,大部分样本的单个细菌 中可以检测到上千个基因,助力了细菌新的耐药 和持留机制的研究发现。
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固定样本实验操作指南
1、取总量大于1000万个细菌,放入1.5 mL 离心管,细菌要単分 散且杂质含量少,离 心去除培养液。
2、加入1mL4%多聚甲醛,放入4°C冰箱 中的旋转混匀仪,旋 转固定5-16小时,离 心去除多聚甲醛。
3、加入ImL含1μL RNA酶抑制剂的 PBS-T(PBS中加入 0.1% Tween-20), 离心清洗样本两次。
4、重悬细菌在200μL的PBS-T中,另加 5μLRNA酶抑制剂, 将离心管密封后,4℃冷链运输。
六、单细胞转录组测序
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VITA单细胞全长转录组测序
VITA单细胞全长转录组测序平台(VITA single-cell full-length RNA sequencing) 是基于基于随机引物、高通量、单细胞全长测序 技术M20-seq的测序平台。基于此平台可实现全 样本,全物种,全长的单细胞转录组研究,将极 大拓宽单细胞研究的应用领域。
动物:人、小鼠、大鼠、爪蟾、斑马鱼、 果蝇等
植物:水稻、拟南芥等
微生物:真菌、细菌、原虫等
•适用物种
细胞悬液,新鲜组织,冻存组织,石蜡 包埋样本,福尔马林固定组织细菌悬液, 微生物组样本(粪便、牙菌斑等)
•捕获细胞数
标准检测:1000至10000个细胞
超高通量:数十万至百万个细胞
•测序平台
兼容川umina测序平台及BGI测序平台